AI和DNA预测创伤几年后的心理健康问题

弗吉尼亚州联邦大学生物标志物研究与精密医学中心宣布了一项新的研究，发表了一项新的分子精神病学，展示了人工智能(AI)和基因组学的结合如何产生DNA生物标志物，可以预测心理健康问题，以预测近17年的心理健康问题.暴露于童年创伤.

儿童创伤是根据符合儿童和青少年精神病学评估(CAPA)的DSM创伤后应激障碍标准的事件以及年轻成人精神病学评估(YAPA)的评估. - 由杜克大学和北卡罗来纳州卫生与公共服务部发起的年度研究称为大烟山研究(GSMS).在每个浪潮中收集血点样品和临床数据.

从超过480名参与者中使用了超过970个血点样本，他们在21岁之前提供了670多个样本，以及一部分超过300名参与者，他们在成年期提供了样本.

"我们从成人结果的DNA甲基化中预测，"该研究作者埃德温·范·登·奥德(Edwin van den Oord)博士说，荷兰精神病遗传学家，教授，教授兼主任生物标志物研究与精密医学中心主任弗吉尼亚州联邦大学. "我们发现了各种各样的结果，例如成人抑郁症，焦虑，酗酒，尼古丁成瘾，贫穷，社会问题和医疗问题."

神经精神疾病和癌症与DNA甲基化的变化有关.在人类基因组中，有2800万个地点可以根据范登·奥德(Van den Oord)进行甲基化.

"我们知道所有SNP(单核苷酸多态性)在哪里，" Van Den Oord说. "我们从人类基因组项目中获取人参考基因组，并寻找CG站点，然后我们加入了所有SNP."

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DNA可以通过环境因素(一种表观遗传学变化)来改变基因表达. DNA甲基化是将甲基添加到DNA碱基的过程，是一种表观遗传修饰.鉴于甲基化经常发生在CPG站点或CG部位，研究人员确定了人类基因组中存在的区域.具体而言，他们确定了DNA的区域，其中胞嘧啶核苷酸之后是鸟嘌呤核苷酸.

确定大多数人可以甲基甲基的所有可能地点，他们的研究人员首先从人类基因组项目中识别人参考基因组中的CpG位点.

"我们将DNA碎裂，然后将其变成像100个碱基对的小碎片，然后对其进行序列，" Van Den Oord说. "现在，我们知道所有这些小片段的顺序.然后我们需要将其与参考基因组保持一致.如果某些东西与具有CPG的位置保持一致，那么我们计算该地点发生了多少甲基化."

科学家使用人工智能(AI)机器学习计算了甲基化风险评分.在AI中，弹性净线性回归是一种结合拉索(绝对收缩和选择算子)和脊回归方法的方法.

AI算法产生的甲基化风险评分的预测能力"高于报告的创伤，无法通过报告的创伤，与人口统计学变量的相关性或从童年到预测的健康问题的连续性来解释.成年."

根据研究人员的说法，甲基化风险得分预测了广泛的不良结果，并且有潜力作为临床生物标志物评估创伤暴露的健康风险的潜力.

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